Il complesso venne edificato sul terreno donato da Martino Cassini alla comunità delle Clarisse conventuali di Lodi

Le monache Benedettine realizzarono la chiesa nel 1588 (attuale Aula Magna). Il chiostro è opera di Giuseppe Piermarini.

La basilica conserva al suo interno altri numerosi pregevoli affreschi e rilievi sempre del XIV secolo.

Nell’ambiente lombardo del secolo XIV, il castello rappresenta un esempio importante di architettura medievale.